O sistema imune inato nasce com o indivíduo e protege o organismo contra agentes patogênicos específicos e toxinas. Esta imunidade inclui a capacidade de fagocitar bactérias e outros agentes invasores, pelos leucócitos e macrófagos dos tecidos. Inclui a capacidade das secreções ácidas do estômago e enzimas digestivas de destruir germes. Inclui a resistência da pele e das membranas mucosas à penetração dos germes. Inclui as lisozimas, a properdina e certos polissacarídeos que neutralizam certas bactérias gram-positivas e gram-negativas frequentes na natureza. A imunidade inata protege o organismo humano contra agentes capazes de provocar doenças em outras espécies animais.